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導讀:
導讀 | 為什么年紀大了,免疫力會下降?為什么免疫系統(tǒng)的衰老速度會因人而異?為什么相比于遺傳,環(huán)境對于免疫系統(tǒng)的影響程度更大?近期,科學家們通過分析單個細胞內(nèi)染色質(zhì)的差異,找到了回答這些問題的新線索。 |
圖片來源:Pixabay
來自于斯坦福大學醫(yī)學院的科學家們完成了這一龐大的工作,分析了大量免疫細胞。他們發(fā)現(xiàn),相比于年輕人,老年人的免疫細胞攜帶更多的染色質(zhì)修飾。而且,這些修飾差異主要來源于環(huán)境。
研究團隊的關注點在于組蛋白(與細胞核內(nèi)DNA緊密結(jié)合的蛋白結(jié)構(gòu))修飾,是表觀遺傳學的重要部分,后者在健康、疾病領域有著不容忽視的地位。相關研究成果在線發(fā)表在一期的《Cell》上。
doi.org/10.1016/j.cell.2018.03.079
表觀遺傳學的影響
蛋白質(zhì)是執(zhí)行細胞活動的主力。一個細胞的身份、功能與其表達的蛋白質(zhì)類型、數(shù)量密切相關。事實上,體內(nèi)的每一個細胞都含有相同的DNA,但是皮膚細胞、脂肪細胞和神經(jīng)細胞表達的蛋白質(zhì)卻有著很大的差異,因此,它們各自執(zhí)行的功能不同。通過基因表達與否,DNA序列上的表觀遺傳標記很大程度上指引、定義了細胞的整體行為。
“除去變異或者染色體末端磨損,DNA在衰老的過程中基本保持不變,但是基因的表達程度卻可能經(jīng)歷著大的變化。”文章通訊作者免疫學和風濕病學教授Paul J. Utz表示道。
此外,伴隨著細胞的分裂、衰老等過程,表觀遺傳修飾會不斷變化。其中,免疫系統(tǒng)中大量白細胞的基因表達水平會伴隨著衰老而發(fā)生顯著的變化。
考慮到這些,研究團隊推測,免疫細胞發(fā)生與衰老相關的變化,可能源于組蛋白修飾的變化。他們想知道,不同免疫細胞類型受表觀遺傳標記變化影響的程度,而且這種影響模式在不同人之間或者同一個個體不同細胞的差異。
衰老的免疫細胞
Paul J. Utz和生物信息學助理教授Purvesh Khatri、基礎生命科學研究副研究員Alex Kuo和博士后Francesco Vallania合作,利用質(zhì)譜流式細胞技術(mass cytometry)從單細胞水平分析了免疫細胞的染色質(zhì)修飾情況。他們分析了22種不同免疫細胞內(nèi)40種不同類型的表觀遺傳標記,共積累了約217億個數(shù)據(jù)點,并進行了專門的數(shù)據(jù)解析。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),許多衰老的免疫細胞比年輕的免疫細胞攜帶更多的組蛋白標記。此外,相比于年輕人,老年人免疫細胞之間的組蛋白修飾差異性更大。
圖片來源:Cell
變化主要源于環(huán)境
為了評估環(huán)境、遺傳對于組蛋白標記模式的影響差異,研究人員從同卵雙胞胎、異卵雙胞胎中獲取血液樣本。其中,同卵雙胞胎擁有相同的DNA序列,分享著共同的宮內(nèi)環(huán)境。雖然異卵雙胞胎DNA有差異,但是宮內(nèi)環(huán)境、成長環(huán)境(一起長大)相同。
結(jié)果顯示,相比于年輕的同卵雙胞胎,年老的同卵雙胞胎之間的組蛋白修飾差異較大。而且這些差異相當于兩個*沒有血緣關系的人。進一步數(shù)據(jù)分析表明,老年人表現(xiàn)出的表觀遺傳差異主要源于非遺傳因素,包括飲食、睡眠、運動、感染、工作、居住的地方,以及生理、心理壓力等。
責編:悠然
參考資料:
Key differences in young, older people's immune cells attributed to environment