SurePrint技術(shù)，寡核苷酸的高通量私人定制

基因芯片、二代測序捕獲Panel，甚至FISH探針，均早已進(jìn)入了私人定制時(shí)代?？煽康乃饺硕ㄖ瓶梢詭椭脩舾玫陌邢蚧蛐蛄心繕?biāo)區(qū)域，在節(jié)省費(fèi)用的同時(shí)獲得目標(biāo)區(qū)域的更可靠的信息。私人定制說來輕巧，門檻可不低。對于終端用戶而言，私人定制往往有不低的起訂量門檻和很長的貨期，這對于正處于優(yōu)化與摸索階段的用戶來說是個(gè)頭疼的問題。對于有些廠家來說，由于其私人定制需要重合光衍生膜或者合成模板，起步成本就很高，同時(shí)占用工廠的產(chǎn)能，如果不設(shè)低起訂量，不僅不*還影響了正常產(chǎn)品的生產(chǎn)。所以，真正意義的私人定制既要有靈活的起訂量又要有合理的可負(fù)擔(dān)的價(jià)格和貨期。

安捷倫擁有的工業(yè)級寡核苷酸合成技術(shù)，借助該技術(shù)安捷倫可以提供業(yè)內(nèi)為靈活的寡核苷酸合成，包括合成基因芯片、二代測序的靶向捕獲探針文庫、FISH探針，以及近非常熱門的CRISPR 向?qū)NA文庫。安捷倫之所以具備如此全面而靈活的合成能力，還要追溯安捷倫的歷史。

很多人不知道，安捷倫源自惠普（HP）。在具有里程碑意義的1999年，安捷倫的老東家惠普宣布戰(zhàn)略性重組，將HP一拆為二，其中安捷倫作為獨(dú)立的測量公司包攬了元器件、測試與測量、化學(xué)分析、和醫(yī)療儀器業(yè)務(wù)，而HP則作為一家計(jì)算機(jī)與影像公司繼承了老東家的名字。HP的打印技術(shù)*，安捷倫借助惠普的技術(shù)優(yōu)勢，直接把噴墨打印技術(shù)用在了寡核苷酸合成上。在一些介紹安捷倫寡核苷酸合成技術(shù)的資料上大家可能會(huì)看到 “inkjet” 技術(shù)。沒錯(cuò)，inkjet就是噴墨技術(shù)，在百度百科里將其解釋為 “一種新的無接觸、無壓力、無印版的印刷技術(shù)，將電子計(jì)算機(jī)中存儲(chǔ)的信息輸入噴墨印刷機(jī)即可印刷”。腦洞大開的安捷倫將不同顏色的墨盒換成了A/T/C/G四種堿基，直接在玻璃片上原位打印合成寡核苷酸，這種寡核苷酸的合成無需接觸、無需制板，直接將電腦里的核酸序列信息轉(zhuǎn)化為玻璃片上的寡核苷酸。這一技術(shù)即我們所說的SurePrint技術(shù)。

圖1. SurePrint 技術(shù)合成寡核苷酸

的噴墨工藝可準(zhǔn)確運(yùn)送極小量的待噴點(diǎn)物質(zhì)到位置，在小小的一塊標(biāo)準(zhǔn)尺寸載玻片上可以打印多達(dá)1百萬條不同的寡核苷酸序列。SurePrint技術(shù)一次打印的寡核苷酸不僅數(shù)量多，同時(shí)質(zhì)量也相當(dāng)可靠。講到質(zhì)量，它包括三個(gè)因素：長度，產(chǎn)率以及準(zhǔn)確度。在傳統(tǒng)的合成技術(shù)下，一旦寡核苷酸的長度超過50 mer，就會(huì)開始累積大量缺失，導(dǎo)致終有效的寡核苷酸的數(shù)量大幅降低。圖2可以清楚的看出，傳統(tǒng)技術(shù)（紅色）在合成50 mer長度的寡核苷酸時(shí)，全長的高保真寡核苷酸的產(chǎn)率不到40%；在合成150 mer長度的寡核苷酸時(shí)，全長產(chǎn)率甚至不到5%，這也就是為什么很多公司提供的合成服務(wù)的價(jià)格隨著核酸長度的增加呈幾十倍的增長。而SurePrint技術(shù)可以妥妥的合成長度超過200 mer高保真度的寡核苷酸，價(jià)格的增加也很有限。對了，SurePrint還有一套完善的實(shí)時(shí)質(zhì)量監(jiān)察系統(tǒng)，它可以對每一次噴點(diǎn)進(jìn)行確認(rèn)，以小化甚至消除漏點(diǎn)以及合成中斷的問題。所以用戶若是想獲得靈活多樣的合成服務(wù)，那非安捷倫莫屬了。

圖2. 傳統(tǒng)合成技術(shù)與SurePrint技術(shù)對比

看到這里，您可能會(huì)問，這么多的寡核苷酸探針要如何設(shè)計(jì)才能確保他們的有效性呢？這里小編就不得不夸一夸功能強(qiáng)大又使用方便的SureDesign免費(fèi)在線設(shè)計(jì)工具。SureDesign是一款基于網(wǎng)頁的應(yīng)用程序，用戶無需付費(fèi)即可使用。在 SureDesign 中，您可以選擇安捷倫目錄產(chǎn)品定義的探針組或構(gòu)建您自己的探針組。比如，利用這款工具，您可以自行設(shè)計(jì)您自主知識產(chǎn)權(quán)的二代測序靶向序列捕獲探針組，只要把需要富集的基因名或坐標(biāo)輸入系統(tǒng)，SureDesign便會(huì)自動(dòng)幫您設(shè)計(jì)優(yōu)化的探針組；如果您相中了某款安捷倫目錄產(chǎn)品，但又想在其基礎(chǔ)上增加或減少一些探針，也可以通過SureDesign實(shí)現(xiàn)。用同樣的方法您還可以設(shè)計(jì)微陣列芯片、FISH探針以及CRISPR的向?qū)NA文庫。是不是非常方便?。∪绻卸ㄖ频男枨?，不妨快來試試SureDesign，自己動(dòng)手設(shè)計(jì)產(chǎn)品！