近日,大連化物所生物分子結構表征新方法研究組(1822組)王方軍研究員團隊與南方科技大學田瑞軍教授、李鵬飛副教授等人合作,利用193nm紫外激光解離—質(zhì)譜裝置,實現(xiàn)了免疫共受體CD28磷酸化胞質(zhì)端與激酶PKCθ的C2結構域識別結合機制解析。
與常規(guī)毫秒級碰撞誘導質(zhì)譜解離(CID)相比,5ns單脈沖193nm紫外激光解離(UVPD)可直接激發(fā)非變性蛋白質(zhì)骨架共價鍵至高能態(tài)引發(fā)高效解離,激發(fā)解離速率提升6個數(shù)量級,位點解離效率和碎片離子產(chǎn)率與其局部非共價作用和微觀結構密切相關,通過碎片離子和解離產(chǎn)率分析可同時獲得蛋白質(zhì)序列和結構信息。目前,193nm紫外激光解離質(zhì)譜尚未商品化設備,僅在少數(shù)實驗室有自主搭建設備。
免疫共受體CD28是癌癥免疫治療的重要靶點,其胞質(zhì)端酪氨酸磷酸化激活引起的下游蛋白識別結合機制尚不清楚。本工作中,研究人員采用光親和質(zhì)譜法發(fā)現(xiàn)CD28磷酸化胞質(zhì)端與激酶PKCθ的C2結構域特異性結合;利用193nm紫外激光解離質(zhì)譜對C2結合前后進行了全序列覆蓋位點光解離效率的差異分析,發(fā)現(xiàn)了光解離效率顯著下降的三個關鍵結合區(qū)域和核心識別位點K49、H63、R68;證明了高能紫外激光解離策略在蛋白質(zhì)動態(tài)識別結構變化分析中的高靈敏度和單位點分辨高精度優(yōu)勢。
大連化物所王方軍和肖春雷研究員通過交叉學科聯(lián)合攻關,在大連相干光源搭建了193nm紫外激光解離-高分辨質(zhì)譜裝置,在前期工作中通過高能光子對多肽分子的高效激發(fā)解離實現(xiàn)了多磷酸化肽修飾位點精確定位(Chin. Chem. Lett.,2018)和蛋白質(zhì)組學規(guī)?;蛄需b定(Anal. Chim. Acta.,2021)。
相關研究結果以“Motif-dependent Immune Co-receptor Interactome Profiling by Photoaffinity Chemical Proteomics”為題,于近日發(fā)表于Cell Chemical Biology上。(文/圖 劉哲益)
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